请问可以通过分子对接方法寻找药物与蛋白受体的共同配体吗？

吧友里的大佬们，跟大家请教一个问题哇:我的一个基因(CDS序列）在人家的一个RNA转录组原始数据里Blast结果是这样的是说明什么问题啊？这个基因就中间这点儿表达了嘛？

各位大佬好 我目前在一所本科学校读生物信息学。本来刚入学的打算是就着生物这一个方向一直读研究生。 可是我现在大三 发现自己大学课程的生物成绩平平无奇。 虽然说没有挂过科 但也是处于B或者B-的等级，学过的课程第二年也大多数没有什么印象。但是生信专业学习的代码课程还是有点基础，请问我这种情况研究生还适合学习生物吗？很迷茫 求解答！谢谢各位

关键词：液体活检；基因检测；变异检测； 文献简介 标题（英文）：Clinical validation of a next-generation sequencing-based multi-cancer early detection “liquid biopsy” blood test in over 1,000 dogs using an independent testing set: The CANcer Detection in Dogs (CANDiD) study 标题（中文）：犬类癌症检测（CANDiD）研究：使用独立测试集对1000多只犬进行基于高通量测序的多癌种早期检测"液体活检"血液测试的临床验证 发表期刊：PLOS ONE 作者单位：圣地亚哥兽医专科医院等 发表年份：2022

本生信小白需要在metabolights或metabolomics workbench上下载mzML,mzXML或mzData格式的数据用作非靶向代谢组数据分析，这些格式的数据到底在哪里啊，我真的找不到啊

用原核生物比较基因组圈图工具BRIG软件，在运行BRIG软件时提示 Error: mdb_env_open: 磁盘空间不足。是怎么回事？电脑其实空间挺足的 感觉不是内存容量不足的问题 有遇到类似的可以解答一下吗？

吧友们，小登我是大一的生物科学专业，对生物信息学很感兴趣，知道它是生物学和计算机学交叉的一门专业，想提前学一点这个东西，以后考研考生物信息学，有没有人可以给我点指导什么的？✍谢大家

亲们，请问在excel里的基因序列要怎么用bioedit打开啊，试了好多次都打不开。我只会用bioedit打开fasta文件

文献简介 标题（英文）：The Impact of ACEs on BMI: An Investigation of the Genotype-Environment Effects of BMI 标题（中文）：ACEs对BMI的影响：探究BMI的基因型-环境效应 发表期刊：Behavior Genetics 作者单位：美国俄勒冈州立大学心理学系 发表年份：2022 文章地址：https://doi.org/10.3389/fgene.2022.816660 长期以来，研究表明童年创伤和逆境与成人负面健康结果之间存在显著关联。这些被称为“童年不良经历或事件”（ACE），包括18岁前儿童所经历的创伤性事件和不安全环境，如虐

想问一下大佬们就业主要看专业实力还是学校啊。现在纠结去考985高校的生物信息学硕士还是华中农业大学的生物信息学的硕士

各位学长姐们好，苯人是某985生信学院学生，现在是本科三年级。计划直博在本校继续读生信。想问问各位前辈，应该从哪些方面着手提升自己的能力。 还有就是有点想读博的时候找机会出国看看（交换，或者联培……都行），有没有什么建议，蟹蟹大家！！

有不少同学在学习过程中遇到网络爬虫一词都是一头雾水。那到底啥是网络爬虫呢？今天大表哥就给大家介绍网络爬虫技术！——什么是爬虫：一种自动获取网络页面内容的程序网络爬虫也叫作网络机器人、网络蜘蛛是一种按照一定规则，自动地抓取网络信息的程序或脚本通用爬虫搜索引擎的爬虫系统追求大的爬行覆盖范围聚焦爬虫针对某种内容爬虫只对特定的网站进行爬取——爬虫的一般流程：Step1-获取网页内容：给一个网址发送请求，该网址会返

变量变量类型运行shell时，会同时存在三种变量：局部变量：局部变量在脚本或命令中定义，仅在当前shell实例中有效，其他shell启动的程序不能访问局部变量。环境变量：所有的程序，包括shell启动的程序，都能访问环境变量，有些程序需要环境变量来保证其正常运行。必要的时候shell脚本也可以定义环境变量。shell变量：shell变量是由shell程序设置的特殊变量。shell变量中有一部分是环境变量，有一部分是局部变量，这些变量保证了shell的正常运行。

例如反应hom__L_c + nadp_c <=> aspsa_c + h_c + nadph_c，去掉流通代谢物后转化为反应的SMILES表示形式[lbk]NH3+[rbk][lbk]C@@H[rbk](CCO)C(=O)[lbk]O-[rbk]>>[lbk]NH3+[rbk][lbk]C@@H[rbk](CC=O)C(=O)[lbk]O-[rbk] 请实现（1）利用代码实现，给反应的SMILES形式添加原子映射信息，变为[lbk]NH3+:0[rbk][lbk]C@@H:1[rbk]([lbk]CH2:2[rbk][lbk]CH2:3[rbk][lbk]OH:4[rbk])[lbk]C:5[rbk](=[lbk]O:6[rbk])[lbk]O-:7[rbk]>>[lbk]NH3+:0[rbk][lbk]C@@H:1[rbk]([lbk]CH2:2[rbk][lbk]CH:3[rbk]=[lbk]O:4[rbk])[lbk]C:5[rbk](=[lbk]O:6[rbk])[lbk]O-:7[rbk]（2）利用Rdchiral

有没有大佬指点一下，为什么调整一个因素的形状颜色会导致所有node的形状颜色发生改变。sos 有没有什么解决办法或者是参考资料可以找找，谢谢大佬，好人一生平安，祝顺利毕业，文章顺利，一切顺利！

擅长单细胞数据分析 10X单细胞联合蛋白组分析 空间转录组数据分析 代谢组 蛋白组分析等等scRNAseq/空间转录组测序数据上游分析1.单细胞数据上游分析，cellranger，fastq生成表达矩阵，loupe文件可利用10x软件分析2.RNAseq上游分析，比对生成counts，tpm，fpkm3.空间转录组数据fastq生成矩阵反卷积对空转数据细胞注释空间marker基因位置展示空间发育轨迹分析空间CNV分析及区域划分空间区域打分及差异分析空间细胞通讯分析......单细胞测序分析，GEO/TCGA数据库分析

有没有大佬知道这个图咋看呀？是一个数据库介绍的文件里的图

用fastqc打开fastqc.gz卡住不动，解压了之后命令行也显示null，这该怎么办呀👀

已经获得PC1和PC2数据，怎么绘制好看的PCA图啊，什么都不懂老师让分析和绘制转录组数据

求助，怎么用这两个文件作图。model_prediction是预测的核糖体密度，zc是对应的密码子

这个专业电脑什么配置能满足专业需求啊

r语言数据分析：t检验，方差检验，相关性，pca等降维算法，机器学习。 r语言各种绘图：箱形图，云雨图，矩阵，网络图

救命，有人会mirna靶基因预测吗，真的搞不懂啊物种是昆虫，目前有mirna的序列以及物种的基因序列，老师说要做匹配，有没有人能帮帮忙

有没有大佬指点一下circexplorer2的安装，自己搞了几天都没弄好需要帮助

985cs本，生信硕士的就业薪资水平大概是个什么级别

请问为什么会出现这种情况，应该如何继续使用啊？

求大佬帮忙做张LD单倍型图，有偿，私聊就可以了！！！

structure录入数据点运行的时候返回上一步是怎么回事

请问有没有会用STAMP软件的大神~~？？ 出现下面这种情况，是哪里出了问题呀~我的profile文件有问题？

是研0新生 有篇论文中生信部分读不懂 十五页的论文 大概有五六页 希望有个大佬教 价格200

大佬，入门机器学习可以看什么书呀。

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GEO下载下来细胞来源、组织来源的数据集样本可以合并成去分析吗？还是要单独每个数据集一起分析？

TCGA幻灯片和相对应的病理图像怎么下载？ 我想下载肺癌的病理学图像和相对应的临床数据和表达数据，新手小白，哪位老师可以指点一下！感激不尽！

请问TCGA用lasso做预后模型，用GEO验证，结果验证组risk全是低风险组，是不是TCGA和GEO两个数据要先做处理，“统一”化？TCGA是从UCSC上下载的

DEG分析可以控制混杂因素吗？ 混杂因素 做差异表达基因（DEG）分析时，可以控制混杂因素嘛？方法是什么？ WGCNA时，如何控制其他混杂因素对基因表达水平和临床特征关系的影响？

如何用R把TCGA 生存率里面days_to_death 这列数字变成T/F 0/1之类的状态形式